Fluorescence in situ hybridizace
Fluorescence in situ hybridizace (FISH) je jednou z několika technik používaných při vyhledávání DNA DNA v buňkách, při hledání přítomnosti nebo nepřítomnosti specifických genů nebo částí genů.
Mnoho různých typů rakoviny je spojeno se známými genetickými abnormalitami. A podle genetiky nejsme jen o dědičnosti. Během života mohou buňky dělat chyby při rozdělení a růstu.
V těchto buňkách se mohou hromadit mutace v DNA, které jsou spojeny s rakovinou.
Jak funguje FISH?
FISH je technika, která používá fluorescenční sondy k detekci specifických genů nebo částí genů (DNA sekvence). Pracovníci laboratoře zdravotnických center a onkologové používají FISH k posuzování pacientů, kteří mohou mít rakovinu, a někdy také k monitorování pacienta, u kterého již byla diagnostikována rakovina a léčena.
FISH se může provádět pomocí různých typů vzorků podle místa a druhu podezření na rakovinu: nádorové buňky získané z periferní krve, biopsie kostní dřeně nebo biopsie lymfatických uzlin a tkáň vložené formalinem (to znamená vzorek tkáně, který je zpracován v laboratoři a vložen do typu vosku, což z něj činí tužší, takže může být nakrájeno na tenké části a namontováno pro prohlížení pod mikroskopem.
Co znamenají písmena?
"H" ve FISH označuje hybridizaci.
Při molekulární hybridizaci se jako sonda používá značená sekvence DNA nebo RNA - vizualizujte červenou cihlu Lego, pokud chcete. Sonda se používá k nalezení protichůdné Lego cihly nebo DNA sekvence v biologickém vzorku.
DNA ve vašem exempláře je jako hromádky Lego cihel a většina cihel v těchto hromadách nebude odpovídat naší červené sondě.
A všechny vaše cihly jsou úhledně uspořádány do 23 párů cihel - každá hromada je jeden z vašich párových homologních chromozomů, více či méně. Na rozdíl od Lego cihel, naše červená Lego sonda je jako silný magnet a najde svůj zápas, aniž by musel třídit hromady.
"F" se týká fluorescence. Naše červená sonda se může ztratit v hromadách cihel, a proto je označena barevným fluorescenčním barvivem, takže bude svítit. Když zjistí, že se shoduje mezi 23 spárovanými hromadami, objeví se tam fluorescenční značka. Takže nyní můžete vidět, jak mohou výzkumníci a lékaři použít FISH, aby pomohli identifikovat, kde (pro kterou rodinu nebo jaký chromozom) je daný jedinec umístěn daný gen.
"I" a "S" stojí na místě . To se týká skutečnosti, že naše červená cihla Lego hledá svůj zápas v rámci vzorku, který jste dal .
Co specifické rakoviny krve?
FISH a další in situ hybridizační postupy se používají k diagnostice různých chromozomálních abnormalit - změn v genetickém materiálu, změnách chromozomů, včetně následujících:
Delece - část chromozomu je pryč
Translokace - část jednoho chromozomu se rozpadne a přilepí se na jiný chromozom
Inverze - část chromozomu se odtrhne a znovu se vloží, ale v opačném pořadí
Duplikace - část chromozomu je přítomna v příliš mnoho kopií v buňce
Každý typ rakoviny může mít vlastní sadu chromozomálních změn a příslušné sondy. FISH nejen pomáhá identifikovat počáteční genetické změny v procesu onemocnění, jako je rakovina, ale může být také použit k monitorování odpovědi na léčbu a remise nemoci.
Genetické změny zjištěné FISH někdy nabízejí další informace o tom, jak se rakovina jedince může chovat, na základě toho, co bylo v minulosti pozorováno u lidí se stejným druhem rakoviny a podobných genetických změn. Někdy se FISH používá po provedení diagnózy, aby se shromáždily další informace, které by mohly předpovědět výsledek pacienta nebo nejlepší léčbu.
FISH může identifikovat chromozomální abnormality v leukémiích , včetně chronické lymfocytární leukémie (CLL). U chronické lymfocytární leukémie / malého lymfocytárního lymfomu umožňuje FISH pacientům zjistit jejich prognostickou kategorii: dobrou, střední nebo chudou. Při akutní lymfoblastické leukémii (ALL), genetika leukemických buněk vám může říci o úrovni rizika rakoviny a pomoci řídit léčebné rozhodnutí.
FISH panely jsou k dispozici také pro lymfomy, mnohočetný myelom, proliferační poruchy plazmatických buněk a myelodysplastický syndrom. V případě lymfomu z plášťových buněk se například vyskytuje translokace, kterou může FISH detekovat nazvaný GH / CCND1 t (11; 14), který je často spojen s tímto lymfomem.
Proč FISH?
Výhodou FISH je to, že se nemusí provádět na buňkách, které se aktivně dělí. Cytogenetické vyšetření obvykle trvá přibližně tři týdny, protože rakovinné buňky musí růst v laboratoři asi 2 týdny, než je mohou testovat. Naproti tomu výsledky FISH jsou zpravidla k dispozici v laboratoři během několika dní.
> Zdroje:
> Cytogenetické testování kodolů CPT.
> Fluorescence in situ hybridizace (FISH). http://www.genome.gov/10000206#al-2.
> Fluorescence in situ hybridizace (FISH). http://www.nature.com/scitable/topicpage/fluorescence-in-situ-hybridization-fish-327.
> Wolff DJ, Bagg A, Cooley LD, et al. Pokyny pro fluorescenční in situ hybridizační testování při hematologických poruchách. Journal of Molecular Diagnostics: JMD. 2007, 9 (2): 134-143.