Další informace o druhu druhu Paenibacillus VT 400
V létě roku 2016 se na výročním zasedání Americké společnosti pro mikrobiologii shromáždili vědci, kteří sdíleli a diskutovali poznatky týkající se světa bakterií a lidského zdraví.
Mezi objevy, skupina hlášená na celém genomu, nebo kompletní soubor genů, pro bakterie zvané kmen druhu Paenibacillus VT 400 (PVT400). Tyto bakterie byly dříve nalezeny v slinách pediatrického pacienta s akutní lymfoblastickou leukémií (ALL).
Podrobné informace z těchto a budoucích studií pomohou vědcům zjistit, zda tyto bakterie mohou mít roli v lidských onemocněních, zejména u lidí s akutní leukémií, u kterých se vyvinou pneumonie nebo infekce krve.
Pneumonie u lidí s rakovinou
Pneumonie je hlavní příčinou úmrtí u pacientů s rakovinou s neutropenií, zejména u pacientů s akutní leukémií. Neutropenie je nízký počet neutrofilů v krvi Neutrofily jsou bílé krvinky, které jsou důležité při pomoci tělu v boji proti infekci .
Infekce dolních cest dýchacích jsou velmi časté u pacientů s rakovinou, přičemž některé zprávy ukazují, že 13 až 31 procent pacientů s leukemií, kteří dostávají chemoterapii, a až 80 procent pacientů po transplantaci hematopoetických kmenových buněk bude mít alespoň jednu epizodu pneumonie.
Neutropenická pneumonie je potenciálně život ohrožující infekce. V takových scénářích lékaři okamžitě zahájí antibiotickou léčbu, aniž by čekali na laboratorní výsledky, aby potvrdily a specifikovaly typ bakteriální infekce - protože je tak důležité zahájit léčbu najednou, aby se snížilo riziko, že pacient podléhá infekci.
Ve skutečnosti se preventivní terapie používá za určitých okolností, které jsou podrobně popsány níže.
Nedávný pokrok v léčbě neutropenické pneumonie vyvolává naději na lepší výsledky. Více lékařských společností vydalo aktualizované pokyny pro antibiotickou léčbu podezření na neutropenickou pneumonii.
A je možné, že novější látky, které podporují reakce těla na infekci, mohou dále zvýšit aktivitu antibiotik.
Zaměření na patogeny u pacientů s neutropenií
Pokyny od Americké společnosti pro klinickou onkologii (ASCO) doporučují, aby se lékaři pokusili zabránit infekci u ambulantních pacientů s hlubokou neutropenií, ale bez horečky. Antibakteriální a antifungální léčba se doporučuje, pokud se očekává, že neutrofily zůstanou pod 100 μl po dobu delší než sedm dní. Pokyn uvádí, že výhodným prostředkem pro antibakteriální preventivní terapii je perorální fluorochinolon, zatímco pro antifungální terapii je perorální triazol.
Pacienti s neutropenií jsou náchylní k mnohem širší paletě patogenů než jejich protějšky. Může být užitečné pro lékaře, aby zvážily, odkud pocházejí bakterie, v předpovědi, které antibiotika jsou pravděpodobné, že budou rezistentní, a které strategie jsou nejpravděpodobněji nejúčinnější.
Paenibacillus druhy
K tomuto účelu vědci studovali PVT400, nové bakterie izolované od pacienta s leukémií, člena rodu Paenibacillus - rodinu tyčinkového druhu bakterií. Různé druhy v této skupině byly izolovány z půdy, vody, rostlin, mléka a dalších míst.
Nebylo však známo, že druhy Paenibacillus způsobují onemocnění lidí. .. dokud nedávné zprávy neukázaly možnou účast tří různých druhů Paenibacillus u lidských nemocí.
Po PVT 400 byl izolován ze slin pediatrického pacienta s akutní lymfoblastickou leukémií , počáteční studie ukázaly určitou podobnost těchto izolátů s druhy amylolyticus, které se vyskytují v larvéch zadní části mouchy; k dnešnímu dni je stále pravdou, že u lidí nebyl zjištěn P. amylolyticus a další studie ukázaly rozdíly mezi kmenovými bakteriemi VT 400 nalezenými u pacienta s rakovinou a dalšími P.
amylolyticus kmenů.
Takže když vyšetřovatelé studovali celý genom VT 400, bylo několik zajímavých zjištění. Měla geny kódující mechanismy rezistence na chemoterapeutické léky, jako je tunikamycin a bleomycin. Rovněž nalezli geny pro bakteriální pumpy spojené s multidrogovou rezistencí, stejně jako geny kódující rezistenci vůči antibiotikům, včetně vankomycinu, fosmidomycinu, tetracykinu, stejně jako penicilinových léků nebo beta-laktamů.
Autoři této genomové studie poznamenali, že kompletní sekvence genomu Paenibacillus sp. kmen VT 400 pomůže určit roli druhů Paenibacillus u lidských nemocí a poskytnout přehled o složení normálních bakterií žijících u pacientů s karcinomem krve.
Zdroje:
> Evans SE, Ost DE. Pneumonie u pacienta s rakovinou neutropenie. Curr Opin Pulm Med . 2015; 21 (3): 260-271.
Rybakova D, Wetzlinger U, Müller H, et al. Kompletní genomová sekvence kmene SB3-1 Paenibacillus polymyxa, bakterie s půdou s antagonistickou aktivitou vůči rostlinným patogenům. Genome Announc . 2015; 3 (2): e00052-15.
De Souza R, Sant'Anna FH, Ambrosini A, et al. Genom Pseudomonas sp. FeS53a, putativní bakterie podporující růst rostlin spojená s rýží pěstovanou v půdách stresovaných železem. Genome Announc. 2015; (2): e00248-15. 10.1128 / genomeA.00248-15.
Spence R, Demchick P., Hornitzky M, et al. Dohled nad novozélandskými včelnicemi pro Paenibacillus alvei. NZ Entomol . 2013; 36: 82-86.
Kim KK, Lee KC, Yu H. a kol. Paenibacillus sputi sp. nov., izolované ze sputa pacienta s plicní chorobou. Int J Syst Evol Microbiol . 2010; 60: 2371-2376.
Mulcahy N. Nové směrnice ASCO o neutropenii a horečce. Medscape Medical News. 16. ledna 2013. K dispozici na adrese http://www.medscape.com/viewarticle/777736.
Flowers CR, Seidenfeld J, Bow EJ a kol. Antimikrobiální profylaxe a ambulantní léčba horečky a neutropenie u dospělých léčených pro maligní onemocnění: Pokyny pro klinickou praxi americké Společnosti pro klinickou onkologii . J Clin Oncol . 2013; 31 (6): 794-810.