Testy amplifikace nukleových kyselin, známé také jako NAT nebo NAAT, se používají k identifikaci malých množství DNA nebo RNA v testovaných vzorcích. Pokud jde o test STD , existují dostupné NAT, které dokáží detekovat řadu různých STD. Ve skutečnosti se většina testů moči na STD provádí pomocí testů amplifikace nukleových kyselin.
Jak testy zesílení nukleových kyselin fungují?
Existuje několik různých druhů testů amplifikace nukleových kyselin, ale všechny jsou založeny na stejném principu.
NAT používá sérii opakovaných chemických reakcí, aby vytvořila četné kopie DNA nebo RNA, které se lékaři snaží zjistit. Tyto reakce amplifikují signál nukleových kyselin ve zkušebním vzorku tak, aby byly snadněji identifikovatelné. Je mnohem jednodušší najít 10 000 kopií genu než 10.
Co to má udělat se zkouškou STD?
Proces amplifikace bakteriálních nebo virových nukleových kyselin není sám o sobě testem STD . Namísto toho, jakmile je množství DNA nebo RNA zvýšeno ve vzorku za použití PCR nebo LCR , použijí se k detekci více konvenčních testů. Tyto testy obvykle zahrnují určitou formu hybridizace nukleových kyselin. V těchto testech se vzorek zkoumá uměle vytvořeným doplňkovým řetězcem DNA nebo RNA, který byl označen určitým způsobem, který usnadňuje jeho detekci. Může to pomoct, aby se zobrazil jako záře v tmavé značce, která se drží jen velmi specificky identifikující informace.
Testy zesílení nukleových kyselin jsou neuvěřitelně užitečné při testování STD. Umožňují lékařům detekovat STD patogen, i když je přítomen jen velmi malý počet organismů. Je to takový druh technologie, který umožnil provést testy moči na STD, které byly dříve detekovatelné pouze tamponem.
Kromě toho, protože testy amplifikace nukleových kyselin jsou neuvěřitelně citlivé na i malé množství virové DNA, jsou velmi důležité pro screening krevního zásobování. Tyto testy umožňují odhalit malé množství HIV a jiných krevních patogenů, které by jinak mohly být vynechány.
Existují také ne-zesílené testy nukleových kyselin pro některé STD, jako je kapavka a chlamydia . Neemplikované hybridizační testy nukleových kyselin se pravděpodobněji používají, pokud se očekává přítomnost velkého množství bakteriální nebo virové DNA (nebo RNA), jako je například uretrální výtěr nebo vzorka bakteriální kultury . Za takových okolností není nutné žádné zesílení. V těchto vzorcích by měla být DNA nebo RNA přítomna v detekovatelných množstvích.
Příklad tohoto testu v akci
Testy amplifikace nukleových kyselin jsou neuvěřitelně citlivé metody detekce přítomnosti bakterií nebo virů v biologickém vzorku. Pokud jde o zjištění genitálního oparu v bolesti od osoby, která má příznaky, tyto testy slouží jako životaschopná alternativa k virové kultuře . Virová kultura může být pro některé laboratoře obtížná. Na rozdíl od herpesových krevních testů NAT stále zahrnuje přímé určení toho, zda je ve vzorku přítomen virus, spíše než hledání protilátek proti herpesu.
Zesílení nukleových kyselin také umožnilo rozšíření chlamydií a screeningu gonorey v celé zemi. Nyní může být takové vyšetření provedeno na vzorcích moči namísto použití uretrálního nebo cervikovaginálního výtěru. Bylo proto snadné testovat velké množství mladých mužů a žen na pohlavně přenosné choroby v různých klinických i neklinických situacích. Shromažďování moči nevyžaduje žádné odborné znalosti lékaře a lidé jsou pravděpodobnější, že budou ochotni pečovat v poháru než podstoupit genitální výtěr.
Výzkumníci také použili testy amplifikace nukleových kyselin, aby získali více informací o rozsahu problému asymptomatických pohlavních chorob ve Spojených státech.
Ve velkém měřítku byly prováděny screeningové programy založené na NAT v armádě, v městských teenagerech, u mužů, kteří mají sex s muži, av jiných vysoce rizikových a nízkorizikových skupinách. Tyto testy umožňují detekci STD v malých vzorcích, které jsou často přijímány jako součást rozsáhlých výzkumných studií o zdravotním stavu populace.
> Zdroje:
> Bernstein KT, Chow JM, Pathela P, Gift TL. Bakteriální pohlavně přenosné onemocnění mimo kliniku - dopady na program pohlavně přenosné nemoci. Sex Transm Dis. 2016 únor; 43 (2 Suppl 1): S42-52. dva: 10.1097 / OLQ.0000000000000343.
> Chow EPF, Walker S, Čtěte TRH, Chen MY, Bradshaw CS, Fairley CK. Použití vlastního hlášení o ústní vodě a detekci hnačky na faryngu pomocí testu amplifikace nukleových kyselin. Sex Transm Dis. 2017 Oct, 44 (10): 593-595. dva: 10.1097 / OLQ.0000000000000654.
> Trembizki E, Costa AM, Tabrizi SN, Whiley DM, Twin J. Příležitosti a nástrahy molekulárního testování pro detekci pohlavně přenosných patogenů. Patologie. 2015 Apr; 47 (3): 219-26. dva: 10.1097 / PAT.0000000000000239.